Daugelis bakterinių vakcinų laikomos nepagrindinėmis, tai reiškia, kad jos nebūtinos visiems šunims.
Anksčiau šunų savininkai skiepijo savo augintinius nuo kiekvienos ligos, kiekvienais metais, o kai kurie veterinarai vis tiek rekomenduoja savo pacientams „kasmet stiprintuvus“. Tačiau tyrimai parodė, kad imunitetas virusinėms ligoms trunka kur kas ilgiau nei vienerius metus. Skiepai nuo bakterinių ligų suteikia trumpesnį imunitetą ir gali būti reikalingi kasmet.
Pagrindinės ir nepagrindinės vakcinos
„2003“ Amerikos gyvūnų ligoninių asociacija sukūrė šunų skiepijimų gairių rinkinį. Gairėse buvo įvesta „pagrindinių“ vakcinų - vakcinų, kurios turėtų būti skiriamos visiems šunims, ir „nepagrindinių“ vakcinų, - tų, kurios turėtų būti skiriamos tik tiems šunims, kuriems gresia užsikrėtimas šia liga. Pagrindinės vakcinos apima parvo, distemper, adenovirusą ir pasiutligę; šios vakcinos yra virusinės ir po pirminės serijos skiriamos trejų metų ar ilgesniam revakcinacijos planui. Skiepijimas nuo pasiutligės yra įpareigotas daugumoje Jungtinių Valstijų, todėl vietos įstatymai gali reikalauti revakcinuoti dažniau nei kas trejus metus.
Bordatella (veislynas kosulys)
Dažniausia nepagrindinė vakcina yra nuo Bordatella bronchiseptica, dažnai vadinamos veislyno kosuliu. Veislyno kosulys iš tikrųjų yra simptomų kompleksas, panašiai kaip peršalimas žmonėms, o peršalimą gali sukelti daugybė skirtingų bakterijų ar virusų. „Bordatella“ vakcina imunizuoja tik kelis iš šių organizmų, todėl vakcinuotiems šunims liga vis tiek gali pasireikšti. „Bordatella“ kadrai kasmet rekomenduojami šunims, kurie dažnai kontaktuoja su kitais šunimis, pavyzdžiui, einantiems į šunų parodas ar dienos priežiūros paslaugas. Daugeliui įlaipinimo veislynų prieš įleidžiant reikia neseniai padarytos „Bordatella“ nuotraukos. Kai kurie veterinarijos gydytojai rekomenduoja šį šūvį kas šešis mėnesius duoti rizikos grupės šunims.
Leptospirozė
Manoma, kad Leptospirosis vakcina gali sukelti daug nepageidaujamų reiškinių, todėl AAHA rekomendacijose rekomenduojama jos neskirti šuniukams iki 12 savaičių amžiaus. Yra keletas Lepto porūšių arba serovarų; rekomenduojama vakcina vėl apsaugo keturis iš jų, tačiau kryžminė apsauga nuo kitų serovarų yra mažai. Didžiausios rizikos šunys yra gyvūnai arba laukiniai žinduoliai; protrūkių piko metu būna lietaus sezono metu, todėl rizikos grupės šunys turėtų būti skiepijami kasmet vėlyvą žiemą.
Laimo ligos
Laimo ligą sukeliančias bakterijas perduoda erkės, o erkių paveiktų šunų savininkai gali apsvarstyti galimybę pasiskiepyti nuo Laimo ligos. Tačiau skiepai yra prieštaringi; jis gali sukelti sunkų neigiamą poveikį, įskaitant Laimo ligos formą. Daugeliui užkrėstų šunų nebus jokių Laimo ligos požymių; tie, kurie paprastai labai gerai reaguoja į antibiotikus. Laimo vakcina neapsaugo nuo kitų erkių platinamų ligų, todėl vakcinuotiems šunims vis dar reikalingi erkių kontrolės metodai.
Šunų gripas
Šunų gripą sukelia H3N8 virusas. Pirmą kartą jis buvo pastebėtas 2004 šunims. Ankstyvas 2009 protrūkis įvyko visoje šalyje, o netrukus po to vakcina buvo pateikta rinkai. Tuo metu H3N8 buvo laikomas „nauju“ patogenu: visiems šunims kilo pavojus užsikrėsti šunų gripu, nes jie niekada anksčiau nebuvo paveikti viruso. Šiandien tikriausiai dauguma šunų turėjo kontaktą su virusu; Vis dėlto šunų gripo simptomai imituoja kenelio kosulio simptomus, o savininkai net negalėjo žinoti, kad jų šuo sirgo gripu. Tik labai nedidelis skaičius šunų sukels rimtas problemas, paprastai kaip antrinė pneumonija. Rizikos šunims priskiriami šunys, laikomi komunalinėse patalpose - liga pirmą kartą buvo pastebėta kurtinių lenktynių trasose, ir tie, kurie yra ten, kur, kaip žinoma, virusas sukelia infekcijas.